感染科创建于2007年，在学科带头人扈晓宇教授的领导下于同年成为国家教委批准的中西医结合临床内科硕士、博士授位点，为我国首批中医药硕、博士授予点，博士后流动站。2009年建设国家级重点学科；2012年建设国家级重点专科。相继入选国家中医药管理局中医、中西医结合传染病临床基地、国家中医药管理局中医肝胆病学重点学科所在单位、四川省肝病中医药防治中心、四川省省级重点专科；是中华中医药学会常务理事单位、中华中医药学会感染病分会副主任委员单位、中华中医药学会中医肝胆病学副主任委员单位、四川省医师分会副主任委员单位、四川省中西医结合学会主任委员单位、四川省微生态学会主任委员单位，全国中医院校《中西医结合传染病学》主编单位、《传染病学》副主编单位。多次参加欧美肝胆病专业学术会议，并与部分国外大学、科研院所、学术团体及学会有着密切的学术联系。现已成为全国著名的临床、教学和科研基地。
主要开展中医中药、中西医结合防治急慢性病毒性肝炎、重症肝炎、肝硬化、肝衰竭、肝癌、酒精性肝病等各种肝病的临床和科研工作，我科在全国率先提出并应用“温肾为主”的方法治疗高ALT水平慢性乙型肝炎；率先系统进行了乙型肝炎相关性慢加急性肝衰竭的中医证型的研究，提出并应用“分期论治”的思想治疗该病；率先开展了急性酒精中毒、酒精成瘾的中医药防治研究。
科室已经开展重型肝炎中药直肠滴注、穴位注射、中药外治等中医特色疗法，已开展重型肝炎的人工肝治疗，肝癌的射频消融、介入治疗等手段。形成了中药联合“射频消融、血管介入”治疗中晚期肝癌、“中药+人工肝”治疗重型肝炎的治疗格局。在重型肝炎、肝硬化、肝癌等疾病的中西医结合诊治中居领先地位。
我科现有结肠途径治疗机1台，人工肝支持系统1台，Fibroscan 1台，三星超声诊断仪1台、多极射频肿瘤消融仪1台、BILT治疗仪2台等先进仪器设备；拥有专科中医诊疗设备：舌诊仪、脉诊仪、电针仪、中药熏蒸蒸汽药浴（汽疗）设备、艾灸治疗仪、熏蒸治疗机等。感染性疾病专科门诊有专科诊断室9间（名医堂专家门诊2间）。年门诊量约5万余人次。病房共设病床60张，出院总人数每年平均1500人，其中每年疑难病例数200余例，急危重病例数1000例。设有中医特色治疗室1间，办公室3间，示教室1间。
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