科室设有呼吸内镜中心、肺功能检查室、慢病管理室、慢阻肺特殊门诊、肺康复中心，配备有创及无创呼吸机、肺功能仪、各型电子支气管镜、氩气刀、冷冻治疗仪、膈肌起搏器、一氧化氮检测仪、振动排痰仪等先进设备,为疑难危重症患者的诊治提供了支持。同时，为呼吸慢病患者促进肺康复也进行了很好的延续管理。
呼吸内镜中心位于治未病中心大楼7楼，占地200余平方米，设有独立的诊疗操作间、清洗间、麻醉复苏区域。拥有较为齐备的呼吸介入诊疗设备：常规支气管镜、荧光支气管镜、超声支气管镜、超细支气管镜、支气管导航系统、氩气刀及冷冻治疗仪等。
呼吸内镜中心开展的技术包括：常规支气管镜检查、荧光支气管镜检查（AFB）、纤维支气管镜下肺泡灌洗术、支气管内刷检、活检术；经支气管肺活检术（TBLB）、经支气管针吸活检术（TBNA）、超声支气管镜引导下的经支气管针吸活检术（EBUS-TBNA）、经支气管镜气管内异物取出术、经支气管镜氩气刀治疗、经支气管镜高频电凝电切治疗、经支气管镜冷冻治疗、经支气管支架置入术、经支气管球囊扩张术、大容量全肺灌洗术等呼吸内镜诊疗技术。
肺功能检查室开展：肺功能检测及评估，肺通气功能测定、肺容积测定、肺弥散功能测定、肺残气容积的测定、肺最大通气量的测定、支气管舒张试验等，为呼吸系统疾病的诊断及鉴别诊断、外科术前评估提供依据，并开展常规体检。
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